Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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