Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP140Q13342 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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