Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CENPFP49454 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CENPFP49454 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms