Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U3KQE9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
U3KQE9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U3KQE9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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