Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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