Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms