Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RAD54L2Q9Y4B4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD54L2Q9Y4B4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms