Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms