Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms