Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NINLQ9Y2I6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NINLQ9Y2I6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms