Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms