Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms