Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms