Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD3Q9UJU5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms