Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms