Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms