Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms