Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms