Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R1BQ9UD71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1BQ9UD71 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms