Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms