Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms