Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms