Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms