Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms