Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF12Q9NZN5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms