Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms