Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT57Q9NWB7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT57Q9NWB7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms