Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ASF1BQ9NVP2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms