Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms