Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT82Q9NSB4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms