Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN4Q9NRL3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms