Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms