Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA4BQ9NPR2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms