Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-5Q9HDB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms