Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms