Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms