Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER1Q9C0I3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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