Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL4Q9C0H6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms