Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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