Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms