Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms