Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms