Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms