Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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