Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms