Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNS3Q9BQ31 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms