Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAM1Q96QH2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAM1Q96QH2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms