Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNBD2Q96M20 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms