Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX22Q96L94 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX22Q96L94 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms