Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms